Исследование сообществ грибов и прокариот уникальных экосистем арктических морей является важным для понимания глобальных биогеохимических циклов и разработки подходов к биоремедиации этих экосистем. C помощью высокопроизводительного секвенирования вариабельных регионов ITS1/ITS2 (в геноме грибов) и V3–V4 гена 16S рРНК (в геноме бактерий) был изучен видовой состав и таксономическая структура сообществ грибов и гетеротрофных бактерий в поверхностных донных отложениях Карского моря с глубин от 16 до 417 м. В грибном биоме преобладали оперативные таксономические единицы (ОТЕ) отдела Ascomycota (более 50% прочтений ITS в каждом из 12 образцов), затем следовал отдел Basidiomycota (10–20%), для Сhytridiomycota этот показатель не превышал 2% прочтений ITS. Существенных различий в структуре микобиома донных отложений Карского моря в зависимости от глубины отбора не выявлено. Преобладали ОТЕ классов Sordariomycetes и Eurotiomycetes,среди последних – представители семейства Aspergillaceae. Базидиальные грибы представлены преимущественно дрожжевыми организмами семейств Filobasidiaceae, Malasseziaceae, Sporidiobolaceae, Tremellaceae. Общее количество грибных пропагул по данным флюоресцентной микроскопии было в диапазоне 207–546 тыс. спор и фрагментов мицелия в 1 г донного грунта, а минимальные их значения зафиксированы на больших глубинах. На всех исследованных станциях показано наличие многочисленных аэробных гетеротрофных бактерий, относящихся к различным семействам, порядкам и классам филумов Pseudomonadota, Actinomycetota, Bacteroidota, Verrucomicrobiota, Gemmatimonadota, Myxococcota и Acidobacteriota. Интересен факт обнаружения в этих верхних окисленных донных отложениях Карского моря нуклеотидных последовательностей, характерных для строгих анаэробов: сульфатредуцирующих бактерий из филума Thermodesulfobacteriota и хемогетеротрофных бактерий из класса Anaerolineae филума Chloroflexota. Полученные данные заметно расширяют знания о разнообразии грибов и бактерий, ключевых гетеротрофных агентов – деструкторов органических веществ в донных грунтах арктических морей.
Из 54 психротолерантных штаммов 16 видов рода , выделенных из грунтов озера Байкал, в ходе последовательного скрининга на твердых и жидких средах было отобрано 12, а 6 штаммов видов: sp., . Они проявляли ингибирующее действие к тест-микроорганизмам INA 00760, АТСС 6633, АТСС 2091 или ATCC25922, а также к штаммам фитопатогенов VKM-B1247 и VKPM F-148. Максимальная антибиотическая активность была установлена для культуральной жидкости (КЖ) и концентрата КЖ штамма sp. 2d-4B при глубинном культивировании в отношении VKM-B1247 и VKPM F-148. На основании данных по эффективному подавлению этих фитопатогенов и оценки влияния этого штамма на прорастание семян однодольного растения и двудольного растения и длину их проростков, показано, что штамм sp. 2d-4B может быть использован для создания биопрепарата.
Индексирование
Scopus
Crossref
Высшая аттестационная комиссия
При Министерстве образования и науки Российской Федерации